Le LCM a pour mandat de répondre à tous vos besoins métabolomiques, de la conception de votre projet à la publication des résultats. Nous pouvons vous offrir de l’aide avec la conception de votre projet, vos demandes de subvention, l’analyse de vos échantillons ou avec le traitement de vos données, leur analyse ou leur interprétation.


Liste de prix 2022

AnalyseClientèle
de l’Université d’Ottawa
et groupes Terry-Fox
Autres
universitaires
Clientèle
industrielle 
Analyse ciblée par CPL-SM, lot complet (IPdMRM)    $105/inj $120/inj $250/inj 
Analyse ciblée par CPL-SM, lot partiel (IPdMRM)    $50/inj $60/inj $110/inj 
Profilage des métabolites par LC-QTOF-MS $45/inj $55/inj $120/inj 
Autres protocoles ciblés LC-QTOF-MS$40/inj $50/inj $120/inj 
CG-SM$60/sample $75/sample $200/sample 
Analyse de traceurs isotopiques stables$60/inj $80/inj $160/inj 
Taux horaire supplémentaire (personnel)$50/hour $100/hour $200/hour 

Prix pour l’élaboration de méthode = prix par injection + taux horaire du personnel

Remarque : Les prix peuvent être modifiés sans préavis. Les échantillons restants sont stockés pendant 12 mois à -80 °C. Les factures sont habituellement émises après l’analyse.

Profilage métabolomique/métabolomique quantitatif

Le centre de métabolomique de l'Université d'Ottawa offre à la fois le profilage et la quantification des métabolites dans une matrice donnée à l'aide de la LC-MS et de la GC-MS (selon la nature chimique des composés et leur efficacité d'ionisation). Cependant, la détection et la quantification dépendent fortement des éléments suivants :  

  • Les étalons authentiques sont disponibles dans le commerce ou il est possible d'obtenir les étalons par synthèse. 
  • La capacité de détecter l'étalon à l'aide de l'un des instruments énumérés. 
  • la capacité d'extraire efficacement les composés dans la matrice donnée et de les dériver si nécessaire (en particulier pour la GC/MS) 
  • La capacité d'avoir une bonne chromatographie des composés endogènes pour les séparer clairement des métabolites confondants.  

Le centre de métabolomique de l'Université d'Ottawa possède actuellement plus de 200 étalons de métabolites authentiques provenant de diverses classes ou groupes, notamment les acyl-coenzymes A, les acides aminés et leurs dérivés, les acides carboxyliques et leurs dérivés, les acides organiques et leurs dérivés, les acides biliaires, carnitine et acyl-carnitine(s), métabolites des voies de la choline et du folate, acide(s) gras (GC-MS uniquement), glycolyse, voie des pentoses phosphates, métabolites des voies du NAD et du tryptophane, nucléotides, nucléosides et dérivés, polyamines, intermédiaires du cycle TCA et vitamines. Nous proposons une analyse quantitative basée sur les voies/groupes. Nous proposons également le profilage des métabolites en faisant de notre mieux pour essayer d'analyser le plus possible à partir d'un ensemble donné d'échantillons.  

Si les composés que vous recherchez ne figurent pas dans notre liste, veuillez prendre rendez-vous pour en discuter avec nous. Nous offrons notre expertise pour créer de nouvelles méthodologies spécifiques à vos besoins. Le développement de méthodes prend du temps et des frais d'analyse personnalisée s'appliquent (temps du personnel et des instruments). 

Métabolomique non ciblée

En raison d'un personnel et d'un temps limités, le centre de recherche de l'Université d'Ottawa n'offre actuellement que l'acquisition de données à l'aide de notre LC-QTOF-MS pour le flux de travail métabolomique non ciblé. 

En payant le temps du personnel du CCM, les étapes suivantes peuvent être effectuées au CCM : 

  • Les données acquises seront en termes de caractéristiques moléculaires (incluant tous les ions et adduits). 
  • La liste générée des métabolites extraits ou "caractéristiques" est soumise à l'alignement des données entre les différents échantillons, ce qui sera fait à l'aide du logiciel Profinder d'Agilent.  
  • L'analyse statistique (univariée) avec le logiciel Mass Profiler Professional d'Agilent, fournira une liste de "caractéristiques" différenciées qui seront "marquées" pour l'identification/la recherche dans les bases de données. Nous ne pourrons pas vous aider à effectuer l'identification/la recherche dans les bases de données en raison du facteur temps, mais nous pouvons vous guider.  
  • Une fois que vous aurez identifié les métabolites de manière putative/tentative, les échantillons seront analysés à nouveau avec des normes authentiques pour confirmation en termes de temps de rétention, de spectre de masse et de correspondance du modèle de fragmentation MS/MS.  
  • L'ajout de normes authentiques dans l'échantillon peut confirmer l'identité en augmentant l'intensité du pic du métabolite significatif ainsi que le temps de rétention, le spectre de masse et le modèle de fragmentation. 

Contactez-nous

Laboratoire central de métabolomique

Adresse postale :
À l’attention de Shama Naz
Laboratoire central de métabolomique
Université d’Ottawa​​​​​​​
Pavillon Roger-Guindon​​​​​​​
451, chemin Smyth, pièce 1129/1130
​​​​​​​Ottawa, ON  K1H 8M5

Shama Naz, PhD

Gestionnaire, Laboratoire central de métabolomique
Bureau : RGN 4108; Laboratoire central de métabolomique : RGN 4520; Laboratoire : RGN 4210B
Téléphone : 613-562-5800 poste  8018
snaz3@uOttawa.ca

Mireille Khacho, PhD

Professeure agrégée, Département de biochimie, microbiologie et immunologie
Directrice, Laboratoire central de métabolomique
mkhacho@uottawa.ca