Le service de confection de micromatrices tissulaires
Cet instrument entièrement automatisé permet de créer facilement et rapidement des micromatrices tissulaires (MMT) constituées de blocs de paraffine en prélevant des carottes de différents blocs donneurs puis en les insérant dans un bloc receveur unique à des endroits prédéterminés.
Le service de confection de micromatrices tissulaires (MMT)
Le service de confection de micromatrices tissulaires - FAQ
Quel diamètre de carottes devrais-je utiliser pour mon projet?
Le diamètre et le nombre de carottes dépendent en principe de la taille du tissu visé. Un diamètre de 0,6 mm qui permet trois ou quatre répliques est généralement recommandé pour mieux préserver le bloc donneur. De nombreux pathologistes préfèrent cependant travailler avec des carottes de 1 ou 1,5 mm de diamètre afin de pouvoir observer davantage l’architecture tissulaire. Il peut être préférable de confectionner deux MMT avec de grandes carottes plutôt qu’une seule avec des carottes nombreuses mais trop petites.

Cela dépend de la taille du poinçon utilisé pour prélever les carottes. Nos blocs de paraffine mesurant 30 mm x 24 mm et 30 mm x 27 mm, le nombre maximum de carottes qu’ils peuvent contenir est le suivant :
30 X 24 mm
Diamètre de la carotte | Nombre de rangées | Nombre de colonnes | Nombre total de carottes |
---|---|---|---|
0,6 mm | 16 | 22 | 352 |
1 mm | 12 | 16 | 192 |
1, 5 mm | 9 | 12 | 108 |
2 mm | 7 | 9 | 63 |
30 X 27 mm
Diamètre de la carotte | Nombre de rangées | Nombre de colonnes | Nombre total de carottes |
---|---|---|---|
0,6 mm | 16 | 28 | 448 |
1 mm | 12 | 21 | 252 |
1, 5 mm | 9 | 15 | 135 |
2 mm | 7 | 12 | 84 |
La plupart des études indiquent que trois carottes mènent à une correspondance de 98 %. Des études récentes recommandent cependant d’utiliser au moins quatre carottes, alors que d’autres font état d’une précision de plus de 95 % avec deux carottes seulement.Au-delà des questions d’hétérogénéité, il est généralement nécessaire d’un point de vue technique d’utiliser plus d’une carotte par cas. En effet, il arrive que des carottes soient égarées pendant la coupe ou les procédures subséquentes, ou que la formation de plis dans une carotte compromette son analyse. Le fait d’avoir plusieurs carottes par cas limite donc les conséquences d’une telle perte.
Il convient de repérer et de marquer la zone de prélèvement des échantillons sur le bloc donneur ou la lame de verre à l’aide d’un stylo résistant aux produits chimiques, d’un marqueur sans xylène ou d’un marqueur permanent (ou de l’annoter sur la lame virtuelle). Délimiter la zone en traçant un cercle de la bonne taille, par exemple un cercle de 1 mm pour une carotte de 1 mm, sans appuyer trop fort sur la surface du bloc. La paraffine peut obstruer la pointe du marqueur. Ne pas enfoncer le marqueur dans la paraffine. Il n’est pas nécessaire d’encercler l’emplacement de chaque carotte; il suffit d’encercler la zone où seront prélevées les carottes. Disposer les blocs et les lames dans l’ordre dans lequel ils seront disposés dans le bloc receveur, soit de gauche à droite jusqu’à la fin de la rangée (10 blocs), puis en partant de la gauche dans la deuxième rangée, et ainsi de suite.
Il est recommandé de marquer la lame colorée à l’hématoxyline-éosine (H&E) qui représente le bloc donneur. Une nouvelle coloration à l’H&E sera nécessaire en cas de différence importante entre le bloc et la lame colorée.
Les frais de confection de MMT comprennent un montant de 2 $ par prélèvement et insertion de carotte, ainsi que le prix d’un bloc récepteur vierge. Peuvent s’y ajouter des coûts pour la coupe et la coloration à l’H&E de lames du bloc donneur afin d’identifier les zones à prélever, ainsi que la coupe et la coloration finales de la MMT. Pour demander la coupe et la coloration à l’H&E de sections d’un bloc donneur, remplir le formulaire « Coupe et coloration de sections du bloc donneur » dans Infinity
Les dimensions d’un bloc donneur ne devraient pas excéder 24 mm x 37 mm x 10 mm (L x H x P). L’utilisation de blocs de paraffine de taille supérieure entraînera des frais d’insertion supplémentaires.Idéalement, les carottes devraient avoir une épaisseur supérieure à 2 mm;une épaisseur inférieure réduira le nombre de lames pouvant être produites à partir de la MMT.
Pour obtenir une carotte de 2 mm d’épaisseur, la zone de tissu (dans le bloc donneur) doit mesurer au moins 0,25 cm2. Le ratio reste identique pour tous les diamètres de carotte.
Une MMT d’un ou de plusieurs blocs, un fichier Excel indiquant les identifiants des blocs donneurs et receveur, la disposition de la MMT (l’emplacement des poinçons dans le bloc récepteur) et des images annotées des blocs donneurs au format JPEG.
Le fichier exporté peut être transféré sur le disque dur externe de la personne chargée de l’analyse.