Formation

Ateliers à Venir

Nous sommes heureux d'annoncer un nouvel atelier sur le traitement et l'analyse statistique des données métabolomiques et protéomiques. L'atelier se tiendra en présentiel du 11 au 13 février 2026.

Cet atelier de trois jours sera axé sur le prétraitement, la visualisation et l'analyse statistique des données pour la protéomique et la métabolomique basées sur la spectrométrie de masse. L'analyse statistique sera effectuée à l'aide d'outils et de logiciels disponibles sur le site web existant ou à l'aide du programme R. Il proposera également une session informelle de questions-réponses.

L'atelier offre une opportunité de formation aux utilisateurs actuels et futurs du JHMSF. Il est ouvert aux étudiants diplômés, aux post-doctorants et aux autres chercheurs dans les domaines de la médecine, de la biologie, de la biochimie, des sciences alimentaires et de la chimie bioanalytique. Les participants auront la possibilité de traiter leurs propres échantillons pendant l'atelier. L'atelier vise à promouvoir la recherche omique et à faciliter les collaborations au sein de la communauté scientifique à travers le Canada.

À la fin de l'atelier, les participants recevront un certificat de participation.

La date limite d'inscription est le 6 février 2026.

FRAIS D'INSCRIPTION À L'ATELIER :

•    200 $ pour les étudiants et les postdoctorants

•    300 $ pour les autres participants

Les frais doivent être payés à l'Université d'Ottawa, au Canada.

Pour vous inscrire ou obtenir de plus amples renseignements, veuillez contacter le Dr Zoran Minic.

Courriel : zminic@uottawa.ca, Téléphone : 1-(613)-562-5800, poste 1626

Thèmes abordés

Introduction à la protéomique et à la métabolomique

•    Les différentes étapes du pipeline d'analyse métabolomique et protéomique

Analyse des données de traitement protéomique et métabolomique

•    Protéomique : MaxQuant, Proteome Discoverer & Métabolomique : MzMine, HMDB et Sirius

Importation, traitement et nettoyage des données (package R tidyverse)

Visualisation des données et analyse statistique

•    Visualisation des données à l'aide d'un diagramme de Venn et d'un graphique en volcan

•    Analyse multivariée

•    Composantes principales

•    -PCA

•    Analyse par grappes

•    -Regroupement hiérarchique (corrélation de Pearson)

•    - Heatmap

NOTE : Cet atelier se déroulera uniquement en anglais. Toutefois, si vous êtes francophone, n'hésitez pas à contacter Zoran pour lui poser vos questions. Il se fera un plaisir de communiquer avec vous en français. Nous nous excusons pour tout inconvénient que cela pourrait causer. 

2025

Nous avons le plaisir d'annoncer un nouvel atelier sur la préparation et l'analyse des échantillons pour la métabolomique non ciblée basée sur la spectrométrie de masse. L'atelier se tiendra au John L. Holmes Mass Spectrometry Facility (JHMSF), dans le Marion Hall (MRN) salle 02, 140 Louis-Pasteur Private, Université d'Ottawa du 20 au 22 mai 2025.

Cet atelier de trois jours se concentrera sur les applications pratiques des techniques bioanalytiques modernes et couvrira une variété de sujets liés à la métabolomique basée sur la spectrométrie de masse, tels que : l'introduction à la métabolomique, les flux de travail de la métabolomique, la préparation des échantillons, les technologies basées sur la métabolomique et l'analyse bioinformatique des données de la métabolomique. La formation pratique comprendra : la préparation des échantillons, le traitement des échantillons nLC-MS/MS, l'annotation et l'identification des métabolites. Une session informelle de questions-réponses est également prévue.

L'atelier constitue une opportunité de formation pour les utilisateurs actuels et futurs du JHMSF. Il est ouvert aux étudiants diplômés, aux post-doctorants et aux autres chercheurs dans les domaines de la médecine, de la biologie, de la biochimie et de la chimie bioanalytique. L'atelier vise à promouvoir les technologies de pointe et à faciliter les collaborations au sein de la communauté scientifique à travers le Canada.

À la fin de l'atelier, les participants recevront un certificat de participation.

La date limite d'inscription est fixée au 16 mai 2025.

Sujets abordés

Introduction à la métabolomique

• Introduction à la métabolomique
• Les différentes étapes du pipeline d'analyse métabolomique

Préparation des échantillons

• Précipitation des protéines (formation)
• Extraction liquide-liquide (formation)
• Extraction en phase solide (formation)

Outils métabolomiques (techniques de séparation et spectrométrie de masse)

Analyse bioinformatique des ensembles de données

• Prétraitement des données de ligne (formation)
• Annotation et identification des métabolites (formation)

Frais d'inscription à l'atelier :

• $200 pour les étudiants et les postdocs
• $300 pour les autres participants

Pour l'inscription et les demandes de renseignements complémentaires, veuillez contacter le Dr. Zoran Minic, qui vous créera un profil infini où vous pourrez remplir le formulaire d'inscription ici : https://secure17.ideaelan.com/uOttawa/Public/AppLogin.aspx link
Si vous payez par chèque, veuillez le libeller à l'ordre de l'Université d'Ottawa et l'envoyer au 550, C.P., Ottawa (Ontario) : Université d'Ottawa et envoyer à 550 Cumberland, Ottawa, Ontario, Canada K1N6N5 : John Holmes Mass Spectrometry Biological Analysis.
Si vous payez par transfert direct, vous aurez besoin d'un formulaire de transfert électronique. Si vous payez par carte de crédit, veuillez nous appeler ou nous envoyer un courriel : - Téléphone : 613-562-5800 poste 1677 - Courriel : cbsfinancialassistant@uottawa.ca

Courriel : zminic@uottawa.ca, Téléphone : 1-(613)-562-5800 poste 1626

2022

Ateliers précédents  (En anglais seulement)

Nous sommes heureux d'annoncer un nouvel atelier sur l'analyse des données pour la métabolomique et la protéomique. L'atelier se tiendra en ligne via Zoom/Teams du 31 août au 2 septembre 2022.

Cet atelier de trois jours se concentrera sur la visualisation des données et l'analyse statistique pour la protéomique et la métabolomique basées sur la SEP.

L'analyse des données sera effectuée soit en utilisant des outils et des logiciels sur le site Web existant, soit en utilisant le programme R. Il offrira également une session informelle de questions et réponses.

L'atelier présente une opportunité de formation pour les utilisateurs actuels et futurs du JHMSF.

Il est ouvert aux étudiants diplômés, aux post-doctorants et à d'autres chercheurs dans les domaines de la médecine, de la biologie, de la biochimie, de la science alimentaire et de la chimie bio-analytique.

Les participants ont la possibilité de traiter leurs propres échantillons pendant l'atelier.

L'atelier vise à promouvoir la recherche en omiques et à faciliter les collaborations au sein de la communauté scientifique à travers le Canada. À la fin de l'atelier, les participants recevront une attestation de participation.

La date limite de candidature est le 29 août 2022.

FRAIS D'ATELIER : 200 $ pour les étudiants et les postdoctorants 300 $ pour les autres participants Les frais doivent être payés à l'Université d'Ottawa, Canada.

Pour vous inscrire et obtenir de plus amples informations, veuillez contacter le

Dr Zoran Minic.

Courriel : zminic@uottawa.ca,

Téléphone : 1-(613)-562-5800 poste 1626